Slovenská filharmónia sa člení na tieto úseky a organizačné útvary:

Úsek priamo riadený generálnym riaditeľom SF 
 

Umelecké zložky

Slovenská filharmónia (orchester) (OSF)
Slovenský filharmonický zbor (SFZ)
Komorné teleso - Slovenský komorný orchester (SKO)
Dramaturgia
Manažment OSF, SFZ, SKO
Manažment Bratislavských hudobných slávností (BHS)
Notový archív
Oddelenie audio video produkcie

Neumelecké zložky

Sekretariát generálneho riaditeľa SF
Personálno-mzdové oddelenie
Oddelenie marketingu a komunikácie

Oddelenie správy budovy, majetku a technológií 
Oddelenie investícií 
Referát kontroly
Referát CO, BOZP a PPO
 

Ekonomický úsek riadený riaditeľom pre ekonomiku

Oddelenie finančno-rozpočtové
Oddelenie účtovníctva

Úsek Dom umenia Piešťany riadený riaditeľom Domu umenia

Referát prevádzky a techniky

Referát dokumentačných a ekonomických činností

Referát propagačných činností a styku s verejnosťou